新模块开发后的18个月为收费期,在此期间,您若是需要进行模块分析,请联系当地经销商,如果您无法找到当地经销商,请联系总部,获取经销商联系方式。
同时,如果您是一个开发者,也可以联系我们进行模块开发,我们将提供广阔的平台,给予一定的报酬。
预处理
预处理就是将基因表达的芯片探针或者测序获得的基因片段,进行各种处理,最终获得基因相对表达值的过程。
准备数据
你必须有一个基因表达数据制作的 RData文件。 示例文件: Demo.RData。
如果没有,你可以先搜索一下在我们的数据库中是否有您需要的数据。你可以使用我们的数据库进行查询和分析。
将准备的eSet数据中的基因表达数据进行预处理;消除实验中的噪点数据以及去除基因几乎没有变化的管家基因等。
在Genelibs 窗口中打开模块
预处理数据是对数据进行一系列的标准操作,通常包含一个或多个数据预处理方法(按此顺序):
数据过滤:设置基因表达值的上限和下限的阈值。任何价值低/高于阈值上限值重置为阈值/上限值
填补缺失的数据以及对数据进行描述:对原始数进行一定的作图分析,确定数据质量和大致的
数据的转换:差异范围将基因的表达值转换为log2值,删除表达过低或者过高、以及变化过小数据
数据的归一化:调整由于基因芯片技术引起的误差
支持芯片:
illnmina系列/affy系列/甲基化芯片等多种;如果芯片平台不在列表中,而数据又来自于平台中的“GEO数据库检索”模块的结果,你可以试一试使用platform列表里的“unkown just try it”选项,但不能保证一定可以出结果。
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